Pada asalnya ditubuhkan untuk menentang ancaman komunis semasa tahun-tahun pemberontakan; peranan VAT 69 telah dikemas kini dan dilatih oleh SAS British bagi pakar dalam peperangan hutan, peninjauan mendalam dan anti-pemberontakan. Pada asalnya dilatih oleh SAS British, komando VAT 69 menjalankan teknik operasi khas darat, laut dan udara, dengan kepakaran dalam peperangan hutan dan misi peninjauan dalam. Mereka melaksanakan operasi khas untuk menyokong Cawangan Khas Polis memerangi pertubuhan subversif dan aktiviti pengganas, menjalankan operasi ofensif menggunakan senjata dan taktik khas, memerangi keganasan, memerangi pemberontakan, menyelamat tebusan, perlindungan rapat dan menyokong pasukan khas, Pasukan Aturgerak Cepat (PAC) atau pasukan infantri Angkatan Tentera Malaysia dalam sebarang langkah keselamatan.[1][7]

Dengan ancaman keganasan yang semakin meningkat sejak serangan 11 September, unit ini semakin menyesuaikan diri untuk menjalankan tugas memerangi keganasan.[8] Dengan tujuan untuk mewujudkan pasukan yang mampu menangani pelbagai operasi (terutamanya operasi memerangi keganasan), PGK telah menjalin hubungan yang lebih erat dengan pasukan khas Angkatan Tentera Malaysia, termasuk Briged Pasukan Payung Ke-10, Grup Gerak Khas, PASKAL dan PASKAU, supaya membolehkan mereka menguatkuasakan keselamatan di dalam sempadan Malaysia dengan lebih berkesan.

Pada 2014, PDRM menubuhkan unit elit baharu, STAFOC, STING dan STAGG. UTK dan VAT 69 diberi satu lagi peranan iaitu menyokong ketiga-tiga unit baharu ini dari segi latihan dan keupayaan teknikal.[9]